Od mechaniki niebieskiej do nanomechaniki białek

Komputerowe symulacje białek ważnych w medycynie
Opiekun: prof. Wiesław Nowak

Ruch atomów w białkach czy kwasach nukleinowych determinowany jest tymi samymi prawami mechaniki jakie wyznaczają ruch planet w Układzie Słonecznym. Oddziaływania mają co prawda inną naturę, jednak z punktu widzenia metod komputerowych symulacje ruchu planet i trajektorii atomów są bardzo podobne.

W projekcie tym poznamy podstawy fizyczne symulacji komputerowych biomolekuł. Wykorzystamy grafikę komputerową, w tym karty GPU i karty stereo, do badania struktury białek ważnych w projektowaniu leków i nowych metod diagnostycznych. Zbudujemy modele materiałów biokompozytowych i poznany ich wytrzymałość mechaniczną w skali nano.
Uczestnicy projektu będą samodzielnie prowadzić obliczenia komputerowe na klastrach równoległych i pod nadzorem naukowców z Zespołu Teoretycznej Biofizyki Molekularnej analizować wyniki. Prace te mogą pomóc w opracowaniu nowych rodzajów leków i w lepszym zrozumieniu przyczyn chorób takich jak dystrofia mięśniowa czy autyzm.

Projekt „Wszechstronność godna Kopernika" realizowany w ramach Priorytetu I, Działania 1.1, Poddziałania 1.1.3. Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka. Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego.